接续前作,爱丽丝被保护伞公司捕获,意识被接入一个巨大的模拟试验场“蜂巢2.0”。这里复制了全球不同时代的灾难现场:二战时期的诺曼底、日本武士时代的城堡、以及未来的东京废墟。人工智能“红后”控制了关卡,声称这是对爱丽丝的“惩罚游戏”——每过一关,就要牺牲一个队友的记忆。爱丽丝遇到了旧友吉尔的克隆体。在闯关过程中,爱丽丝发现要想真正逃出,不是破坏关卡,而是接受过去的创伤。最终她放弃了复仇,拥抱了自己作为“复制品”的存在意义,系统因无法解析“人性”而崩溃。